外贸自建站可以选择用公司名义注册，也可以选择以个人名义注册，具体取决于您的业务需求和个人情况。下面是一些考虑因素：

1、法律责任与信誉：使用公司名义注册可以更好地将个人和商业活动分开，在法律上形成有限责任保护。此外，对于一些海外买家来说，公司形式可能更加正规可信。

2、税务处理：不同国家和地区对个人和企业的税收政策有所不同。一般来说，企业形式可能会有更多可利用的税收优惠或减免措施。但同时也需要按照当地法律规定完成相应的财务报告等义务。

3、账户开设及收款：部分支付平台（如PayPal）在处理大额交易时，对企业账户的支持更好；同时，如果想要开设海外银行账户进行跨境收付款，则通常需要提供公司的相关证明文件。

4、品牌建设与发展潜力：长远来看，以公司形式运营有利于品牌形象塑造以及未来可能的资金筹集、合作伙伴关系建立等方面的发展。

5、隐私保护：个人名义下运营网站，个人信息更容易被公开查询到；而通过公司则可以在一定程度上保护创始人的私人信息不被直接暴露。

综上所述，如果您打算长期经营并且希望构建一个更专业、更具规模化的在线商店，建议以公司名义来注册外贸自建站。当然，最终决定还需结合您所在地区的法律法规以及自身实际情况做出。如果有条件的话，咨询专业的法律顾问也是一个不错的选择。